培養(yǎng)單晶有那些方法和技巧? 二維碼
發(fā)表時(shí)間:2020-11-27 11:38作者:鑠思百檢測(cè)來源:鑠思百檢測(cè) 單晶結(jié)構(gòu)是用來了解晶型的晶體結(jié)構(gòu)和確定藥物分子的立體化學(xué)結(jié)構(gòu)最具說服力的數(shù)據(jù),但培養(yǎng)單晶通常很有挑戰(zhàn)性,需要耐心和細(xì)心??蒲腥藛T需要具有很高的晶體生長技巧和豐富的單晶培養(yǎng)經(jīng)驗(yàn),能根據(jù)藥物分子的物化性能選擇最適合的結(jié)晶方法。 單晶培養(yǎng)方法包括溶劑揮發(fā)法,冷卻結(jié)晶法,蒸氣擴(kuò)散,液-液擴(kuò)散法,懸滴法,升華法,共晶生成法等。單晶培養(yǎng)的方法多種多樣,常用的有溶劑緩慢揮發(fā)法,液相擴(kuò)散法和氣相擴(kuò)散法。99%的單晶是 用以上三種方法培養(yǎng)出來的。 單晶培養(yǎng)所需樣品用量 一般以10-25mg為佳,假如你只有2mg左右樣品,也沒關(guān)系,但這時(shí)就要選擇液相擴(kuò)散法 和氣相擴(kuò)散法,不能使用溶劑緩慢揮發(fā)法。 單晶培養(yǎng)的樣品的預(yù)處理 樣品溶解后一定要過濾,不能用濾紙,而是用一小團(tuán)棉花輕輕的塞在滴管的中下部或下部, 不要塞太緊,否則流的太慢。樣品當(dāng)然是越純?cè)胶?,不過假如實(shí)在沒辦法弄純也沒關(guān)系,培 養(yǎng)一次就相當(dāng)于提純了一次,我經(jīng)常用一些TLC顯示有雜點(diǎn)的東西長單晶,但得多養(yǎng)幾次。 一定要做好記錄 一次就得到單晶的可能性比較小。因此最好的方法就是在第一次培養(yǎng)單晶的時(shí)候,采取少量 多溶劑體系的辦法。 假如你有50mg樣品,建議你以5mg為一單位, 這樣你可以同時(shí)實(shí)驗(yàn) 10種溶劑體系,而不是選兩種溶劑體系,每個(gè)體系25mg。這是做好記錄就非凡重要,以免 下次又采用已經(jīng)失敗的溶劑體系,而且單晶解析 時(shí)必須知道所用的溶劑。 培養(yǎng)單晶時(shí),最好放到?jīng)]人碰的地方,這點(diǎn)大家都知道。我想說的是你不能一天去看幾次 也不能放在那里5,6天不管。也許有的溶劑體系一天就析出了晶體,結(jié)果5天后,溶劑全 干了。一般一天看一次合適,看的時(shí)候不要?jiǎng)铀C黠@不行的體系 (如析出絮狀固體)就要重新用別的溶劑體系再重新培養(yǎng)。液相擴(kuò)散法中良溶劑與不良溶劑的比例最好為1:2-1:4。 烷基鏈超過4個(gè)碳的很難培養(yǎng)單晶。 分子中最好不要有叔丁基,因?yàn)檩p易無序,影響單晶解析的質(zhì)量。 含氯的取代基一般輕易長單晶,如4-氯苯基取代化合物比苯基取代化合物輕易長單晶。 單晶培養(yǎng)-無水無氧條件下的單晶培養(yǎng),麻煩的方法我就不說了,最簡單的方法就是將 你的固體樣品加入一帶橡皮塞的容器(最常用的就是核磁管,塞子不是 我們常用的硬塞子, 而是軟的橡皮塞(隨便什么塞子都行,只要能密封且能扎針頭),先抽真空,然后通氮?dú)猓?再用注射器加入良性溶劑,充分溶解(超聲),然后 再用注射器沿器壁加入不良溶劑即可。你將會(huì)發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)單晶不僅需要耐心,而且還需要一雙靈巧的雙手。結(jié)晶過程對(duì)溫度和其它 輕微的擾動(dòng)都非常敏感。因此,應(yīng)該在相似的條件下多嘗試幾個(gè)不同的實(shí)驗(yàn)溫度,并為單晶的生長尋找一個(gè)沒有干擾的安靜環(huán)境。 方案#1 ● 有時(shí)好的單晶僅需冷卻溶液即可生長。你也可以嘗試加熱溶液至所有物質(zhì)完全溶解,達(dá)到過飽和,再慢慢地使其冷卻。 方案#2 1)選取一種可以溶解你的目標(biāo)化合物的溶劑,制成飽和溶液。 2)如果有必要,可以通過過濾除去其中的不溶性雜質(zhì)。對(duì)于少量溶液,可使用一種有效的 過濾器,其制備方法是:將玻璃毛(甚至可以用面巾紙)塞入一根一次性Pasture滴管中, 然后填入一英寸左右助濾物(如硅藻土Celite)。用新鮮溶劑濕潤硅藻土,然后用球形壓力 器將溶液壓過該管進(jìn)行過濾。 3)尋找另一種溶劑,使目標(biāo)化合物在其中不溶解(或僅微量溶解),而且這種溶劑能夠和 前一種溶劑混溶,并具有較低的密度。 4)將第二種溶劑小心地鋪在小瓶中飽和溶液的上面。在兩相界面上可看到一些混濁物。單 晶將會(huì)沿著這個(gè)界面生長。 方案#3 ● 將盛有飽和溶液的小瓶放置在另外一個(gè)較大的瓶中。 在外面的大瓶中加入第二種溶劑并且 蓋緊蓋子。第二種溶劑將會(huì)慢慢地?cái)U(kuò)散到飽和溶液中,晶體就會(huì)出現(xiàn)了!為了進(jìn)一步減慢這 個(gè)過程,可將這個(gè)擴(kuò)散裝置放在冰箱中。 可以嘗試的溶劑系統(tǒng): CH2Cl2/乙醚或戊烷 ,THF/乙醚或戊烷 甲苯/乙醚或戊烷 水/甲醇 CHCl3/正庚烷 金屬配合物單晶的培養(yǎng) 單晶培養(yǎng)的具體操作方法:四條注重事項(xiàng):1、結(jié)晶容器的選擇(敞口燒杯,既不能用從未 使用過的新燒杯,也不能用很舊的燒杯。可能原因?yàn)?,燒杯太新,不利?晶核的形成,而 太舊則形成晶核的部位太多,不利于單晶的生長。) 2、溶劑的選擇(合適的溶劑將物質(zhì)溶 解,溶解性不能太好也不能太差且具有一定的揮發(fā)性,不能揮發(fā)太快也不能太慢)3、結(jié)晶 速度(盡量慢的讓溶劑揮發(fā),一旦 析出結(jié)晶,過濾,可能得到單晶也可能是混晶,千萬別 用母液洗晶體)4、環(huán)境的選擇(放在一個(gè)平穩(wěn)的地方,千萬不能有一絲一毫的震動(dòng),否則 即使得到單晶也全 完了)。 方法一:揮發(fā) 用金屬配合物的良溶劑將其溶解在小燒杯中,小燒杯的內(nèi)表面越光滑單晶性越好,否則晶體 外形不好缺陷多就會(huì)給后面的收單晶衍射數(shù)據(jù)帶來麻煩,甚至?xí)斐蔁o法 解晶體結(jié)構(gòu),那 將是非常可惜的;燒杯用濾紙或塑料薄膜封口防止灰塵落入,同時(shí)減慢揮發(fā)速度,長出較好 晶形的單晶,一般揮發(fā)性稍差的溶劑用濾紙,如,水等。 靜置至發(fā)現(xiàn)滿足的晶體出現(xiàn)。 方法二:擴(kuò)散 用金屬配合物的良溶劑將其溶解在小燒杯或廣口瓶中,塑料薄膜封口(用針戳3-5個(gè)小孔), 放于盛有該金屬配合物的揮發(fā)性不良溶劑(一般用乙醚)的大瓶子中。靜置至發(fā)現(xiàn)滿足的晶 體出現(xiàn)。 方法三:分層 將金屬的水溶液放于試管下層,配體的有機(jī)溶劑溶液放于試管上層,中間是水和有機(jī)溶劑的 混合溶劑,封口。操作要小心,最好是用滴管伸進(jìn)試管靠近液面緩慢滴加。靜置至發(fā)現(xiàn)滿足 的晶體出現(xiàn)。JPt 化學(xué)化工資源導(dǎo)航 以上是我在培養(yǎng)配合物單晶常用的方法,一般是幾種方法同時(shí)做,不是每種方法都能或總能培養(yǎng)出單晶,更多的是取決于配合物的結(jié)晶性好壞??傊褪嵌嘣嚕翰煌臏囟?、溶劑、混 合溶劑的比例 1.制備結(jié)晶,要注重選擇合宜的溶劑和應(yīng)用適量的溶劑。合宜的溶劑,最好是在冷時(shí)對(duì)所需 要的成分溶解度較小,而熱時(shí)溶解度較大。溶劑的沸點(diǎn)亦不宜太高。一般常用甲醇、丙酮、 氯仿、乙醇、乙酸乙醋等。但有些化合物在一般溶劑中不易形成結(jié)晶,而在某些溶劑中則易 于形成結(jié)晶。 2.制備結(jié)晶的溶液,需要成為過飽和的溶液。一般是應(yīng)用適量的溶劑在加溫的情況下,將化 合物溶解再放置冷處。假如在室溫中可以析出結(jié)晶,就不一定放置于冰 箱中,以免伴隨結(jié) 晶析出更多的雜質(zhì)。“新生態(tài)”的物質(zhì)即新游離的物質(zhì)或無定形的粉未狀物質(zhì),遠(yuǎn)較晶體物質(zhì) 的溶解度大,易于形成過飽和溶液。一般經(jīng)過精制的 化合物,在蒸去溶劑抽松為無定形粉 未時(shí)就是如此,有時(shí)只要加入少量溶劑,往往立即可以溶解,稍稍放置即能析出結(jié)晶。 3.制 備結(jié)晶溶液,除選用單一溶劑外, 也常采用混合溶劑。一般是先將化合物溶于易溶的溶劑 中,再在室溫下滴加適量的難溶的溶劑,直至溶液微呈渾濁,并將此溶液微微加溫,使溶液 完全澄清后放置。 4.結(jié)晶過程中,一般是溶液濃度高,降溫訣,析出結(jié)晶的速度也快些。但是其結(jié)晶的顆粒較 小,雜質(zhì)也可能多些。有時(shí)自溶液中析出的速度太快,超過化合物晶核 的形成勸分子定向 排列的速度,往往只能得到無定形粉未。有時(shí)溶液太濃,粘度大反而不易結(jié)晶化。假如溶液 濃度適當(dāng),溫度慢慢降低,有可能析出結(jié)晶較大而純度 較高的結(jié)晶。有的化合物其結(jié)晶的 形成需要較長的時(shí)間。 5.制備結(jié)晶除應(yīng)注重以上各點(diǎn)外,在放置過程中,最好先塞緊瓶塞,避免液面先出現(xiàn)結(jié)晶, 而致結(jié)晶純度較低。假如放置一段時(shí)間后沒有結(jié)晶析出,可以加入極微 量的種晶,即同種 化合物結(jié)晶的微小顆粒。加種晶是誘導(dǎo)晶核形成常用而有效的手段。一般地說,結(jié)晶化過程 是有高度選擇性的,當(dāng)加入同種分子或離子,結(jié)晶多會(huì) 立即長大。而且溶液中假如是光學(xué) 異構(gòu)體的混合物,還可依種晶性質(zhì)優(yōu)先析出其同種光學(xué)異構(gòu)體。沒有種晶時(shí),可用玻璃棒蘸 過飽和溶液一滴,在空氣中任溶劑揮 散,再用以磨擦容器內(nèi)壁溶液邊緣處,以誘導(dǎo)結(jié)晶的 形成。如仍無結(jié)晶析出,可打開瓶塞任溶液逐步揮散,慢慢析晶?;蛄磉x適當(dāng)溶劑處理,或 再精制一次,盡可能 除盡雜質(zhì)后進(jìn)行結(jié)晶操作。 6.在制備結(jié)晶時(shí),最好在形成一批結(jié)晶后,立即傾出上層溶液,然后再放置以得到第二批結(jié) 晶。晶態(tài)物質(zhì)可以用溶劑溶解再次結(jié)晶精制。這種方法稱為重結(jié)晶法。 結(jié)晶經(jīng)重結(jié)晶后所 得各部分母液,再經(jīng)處理又可分別得到第二批、第三批結(jié)晶。這種方法則稱為分步結(jié)晶法或 分級(jí)結(jié)晶法。晶態(tài)物質(zhì)在一再結(jié)晶過程中,結(jié)晶的析出 總是越來越快,純度也越來越高。 分步結(jié)晶法各部分所得結(jié)晶,其純度往往有較大的差異,但常可獲得一種以上的結(jié)晶成分, 在未加檢查前不要貿(mào)然混在一起。 7.化合物的結(jié)晶都有一定的結(jié)晶外形、色澤、熔點(diǎn)和熔距,一可以作為鑒定的初步依據(jù)。這是非結(jié)晶物質(zhì)所沒有的物理性質(zhì)。 化合物結(jié)晶的外形和熔點(diǎn)往往因所用 溶劑不同而有差異。 原托品堿在氯仿中形成棱往狀結(jié)晶,熔點(diǎn)207℃;在丙酮中則形成半球狀結(jié)晶,熔點(diǎn)203℃; 在氯仿和丙酮混合溶劑中則形成以上兩種晶形 的結(jié)晶。所以文獻(xiàn)中常在化合物的晶形、熔 點(diǎn)之后注明所用溶劑。一般單體純化合物結(jié)晶的熔距較窄,有時(shí)要求在 0.5℃左右,假如 熔距較長則表示化合物不純。 無水無氧條件下的單晶培養(yǎng) (1) 溶劑的選擇與加入方法 在單晶的培養(yǎng)過程中,我走了與正常結(jié)晶相反的路子。通常是用適量極性大的溶劑提取你的反應(yīng)物質(zhì),然后再滴加少量的極性小的溶劑,放置結(jié)晶。這樣做的結(jié) 果是結(jié)晶很慢,而 且是結(jié)晶的收率不高。而我用的方法是背道而行。先用極性小的溶劑提取。根據(jù)你的反應(yīng)物 質(zhì)量,加入適量的極性小的溶劑,不能全溶解,就加入 適量的極性大的溶劑(注意:切不可 多加),如果此時(shí)還有少量沒有溶解,A)你可以再加重復(fù)極性小的溶劑,再加極性大的溶劑。 直到全溶解;B)也可以微熱溶 解(如果你的樣品是熱穩(wěn)定好的話)這樣的做法是非常好結(jié)晶 的,不信你試試看,如果你晚上做的這樣的操作,第二天早上你會(huì)發(fā)現(xiàn)你的晶體已經(jīng)長出來 了。C)微 熱還有些沒溶解,就直接過濾。這樣也可以很快結(jié)晶。但是會(huì)損失些產(chǎn)物。 (2)溫度的選擇 上面談了溶劑的選擇,和加入順序。現(xiàn)在我再來說說溫度的選擇。 溶劑加入后就要選擇放那里結(jié)晶了 。你不能總認(rèn)為溫度越低越好,要想得到好的晶體,溫 度的選擇很重要的!??!首先放在室溫(必須無外界震動(dòng))一兩天看看,有無結(jié)晶,如有結(jié)晶 說明室溫就能結(jié) 出好晶體,無需放之低溫。如果室溫不結(jié)晶,再放如 0 度。過兩天看看, 再不行,-5 度,-10 度,-15 度,-20 度,-30 度,我想,這些條件大家實(shí)驗(yàn)應(yīng) 該不 難。如過你一開始放于低溫可能結(jié)晶很快但的不到好的晶體??赡苁嵌嗑?,而不是單晶。長 晶體過程千萬不能震動(dòng)。有條件的單獨(dú)一間房間來結(jié)晶最好。 低溫結(jié)出的晶體再送測(cè)試前要處理,不能那出來就去測(cè)。 為什么??? 大家想啊。。。 拿出來到室溫,不是溫度升高了嗎?那晶體就可能融化了 (我作過這樣的蠢事),首先你的 去掉部分溶劑才行。只留少許即可。對(duì)水,氧氣敏感的的用惰性氣體如N2,Ar0保護(hù)。)起來 再轉(zhuǎn)移溶劑。轉(zhuǎn)移完再?zèng)_N2下關(guān)畢你裝晶體的容器活塞。去測(cè)試,這樣就不會(huì)化了。 (3)利用溶劑的揮發(fā) 無水無氧要求的金屬配合物這種情況的培養(yǎng)單晶要求有手套箱,在手套箱里(有這樣的條 件),你可以用 schlenk 瓶、小燒杯、以及核磁管來用作結(jié)晶的工具。容器的口部用封模封 好。然后上面用細(xì)針扎幾個(gè)小眼用來揮發(fā)溶劑。不幾天你會(huì)發(fā)現(xiàn)你的容器內(nèi)辟會(huì)生長出晶體 來。容 器的內(nèi)表面越光滑單晶性越好,否則晶體形狀不好缺陷多就會(huì)給后面的收單晶衍射 數(shù)據(jù)帶來麻煩,甚至?xí)斐蔁o法解晶體結(jié)構(gòu),那將是非??上У?;要強(qiáng)調(diào)的是用 Schlenk及 核磁管這兩種容器用來結(jié)晶是最好的。為什么呢??做無水無氧的人知道 schlenk 是無水無 氧操作的專用瓶。它有側(cè)活塞用來開關(guān)瓶與外界 的相通。所以操作方面很好。在你獲得很 好單晶后你要從手套箱里拿出來啊,如果你用別的容器,可能那些對(duì)空氣特別敏感的物質(zhì)就 不能夠穩(wěn)定到你測(cè)量完晶體結(jié) 構(gòu)。同樣很小的核磁管也很好封的。而且它要的量很少。不 浪費(fèi)樣品。如果沒有手套箱的話,可能這個(gè)方面就不太適用(對(duì)于對(duì)水,氧敏感的物質(zhì)。 (4)利用極性?。ㄈ芙舛刃。┑娜軇? 你的反應(yīng)結(jié)束后,用極性大的溶劑提取后。再進(jìn)行濃縮恰好到有溶質(zhì)析出時(shí)為此(此時(shí)因減 壓濃縮體系內(nèi)的溫度應(yīng)該低于外界)等到溫度升到室溫,拿到手套箱內(nèi), 用針筒向上面的 溶液面上輕輕的滴加幾滴極性小的(溶解度小的)溶劑。這樣處理完你會(huì)很易得到很好的晶 體的。此時(shí)如果你細(xì)心的話你會(huì)發(fā)現(xiàn),你的晶體結(jié)晶時(shí)是 從液面開始的。為什么???仔 細(xì)想。 以上是我在培養(yǎng)要求比較苛刻有機(jī)金屬配合物單晶常用的方法,一般是幾種方法同時(shí)做,不 是每種方法都能或總能培養(yǎng)出單晶,更多的是取決于配合物的結(jié)晶性好壞。總之就是多試: 不同的溫度、溶劑、混合溶劑的比例…… 總之,單晶的培養(yǎng)溶劑的選擇很重要,有些時(shí)候你會(huì)發(fā)現(xiàn)你選擇的溶劑不同,即使你很溶劑 得到晶體,但是晶體的形狀會(huì)各不相同的。甚至有些時(shí)候你得到的晶體不 是規(guī)則的,或是 細(xì)長的針狀的,所以溶劑的選擇很重要。我總結(jié)出來,一般我做反應(yīng)時(shí)候用極性相對(duì)大些的 甲苯、乙醚、THF 等。再結(jié)晶時(shí)候用極性小些正己烷、 以及正己烷與甲苯的混合溶劑,或 其它的混合溶劑。
晶體的生長是一個(gè)動(dòng)力學(xué)過程,由化合物的內(nèi)因(分子間色散力偶極力及氫鍵)與外因(溶 劑極性、揮發(fā)或擴(kuò)散速度及溫度)決定。晶體的培養(yǎng)實(shí)質(zhì)是一個(gè)飽和溶液 的重結(jié)晶過程,使溶液慢慢飽和的方法(如溶液揮發(fā)、不良溶劑的擴(kuò)散及溫度的降低)都可。有些化合物易 結(jié)晶,經(jīng)常有人將無機(jī)鹽晶體去檢測(cè)的例子(無機(jī)鹽易結(jié) 晶)。 有以下兩種方法較常用: 1) 揮發(fā)溶劑法: 將純的化合物溶于適當(dāng)溶劑或混和溶劑。(理想的溶劑是一個(gè)易揮發(fā)的良溶劑 和一個(gè)不易揮發(fā)的不良溶劑的混和物。)此溶液最好稀一些。用氮/氬鼓泡 除氧。容器可用橡膠塞(可緩慢透過溶劑)。為了讓晶體長得致密,要揮發(fā)得 慢一些,溶劑揮發(fā)性大的可置入冰箱。大約要長個(gè)幾天到幾星期吧。 2) 擴(kuò)散法: 在一個(gè)大容器內(nèi)置入易揮發(fā)的不良溶劑(如戊烷、已烷),其中加一個(gè)內(nèi)管,置入 化合物的良溶劑溶液。將大容器密閉,也可放入冰箱。經(jīng)易揮發(fā)溶劑向內(nèi)管擴(kuò)散 可得較好的晶體。時(shí)間可能比揮發(fā)法要長。 另外如果這一化合物是室溫反應(yīng)得到,且產(chǎn)物比較單一,溶解度較小,可將反應(yīng)物 溶液分兩層放置,不加攪拌,令其緩慢反應(yīng)沉淀出晶體。 容易結(jié)晶的東西放在那里自己就出單晶,不容易結(jié)晶的怎么弄也是不出。好像不是想做就能做出來的。 首先看一下產(chǎn)物的溶解度,將產(chǎn)物抽干后用良性溶劑溶解成飽和溶液 (如用二氯甲烷),然后加入相同體積的不良性溶劑,若產(chǎn)物不穩(wěn)定應(yīng)在惰性氣體的保護(hù)下進(jìn)行操作,完成后置于冰箱中冷凍至單晶析出,或直接用惰性氣體鼓泡直至單晶析出。 |